Mentoring merupakan kegiatan yang dilakukan sebagai penunjang mata pelajaran agama. Dalam program ini peserta akan dibagi dalam kelompok-kelompok kecil dengan mentornya masing-masing. Pada kelompok ini perkuliahan dilaksanakan di luar kelas dimana pengisinya adalah masing-masing mentor. Mentoring merupakan kegiatan yang terjadwal, berlangsung selama 1 (satu) semester, dengan frekuensi setiap minggu sekali. Jadwal kegiatan mentoring dilaksanakan sesuai dengan kesepakatan mentoring dan mentee perkelompok. Khusus untuk mentoring agama Islam, materi yang diajarkan adalah peningkatan dalam membaca Al-Qur’an serta pengetahuan agama Islam lainnya. Karena pembelajaran ini bersifat pendampingan, terkadang siswa membutuhkan seseorang yang mampu memotivasi dan mendengarkan ceritanya. Kegiatan ini cocok untuk membantu siswa tingkat I yang sedang mengambil mata kuliah agama yang membutuhkan konsultasi/bantuan. BPA melalui Badan Mentoring menyelenggarakan kegiatan mentoring bagi umat Islam, Protestan, Katolik dan Hindu. Para Mentee diasuh langsung oleh para mentor yang sudah berpengalaman dibidangnya.